Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAE8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAE8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9DAE8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9DAE8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DAE8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAE8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms