Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnot8Q9D8X5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot8Q9D8X5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms