Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
U2af1Q9D883 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
U2af1Q9D883 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
U2af1Q9D883 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms