Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndufb8Q9D6J5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndufb8Q9D6J5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 321 ms