Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabra4Q9D6F4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabra4Q9D6F4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms