Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PudpQ9D5U5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PudpQ9D5U5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms