Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5F6

4930447A16Rik, RIKEN cDNA 4930447A16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447A16RikQ9D5F6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
4930447A16RikQ9D5F6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930447A16RikQ9D5F6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930447A16RikQ9D5F6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms