Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ubxn11Q9D572 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubxn11Q9D572 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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