Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3a3Q9D554 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sf3a3Q9D554 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms