Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcc1Q9D4H2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gcc1Q9D4H2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms