Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Urm1Q9D2P4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Urm1Q9D2P4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms