Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lingo1Q9D1T0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lingo1Q9D1T0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lingo1Q9D1T0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lingo1Q9D1T0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lingo1Q9D1T0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms