Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm6Q9CZ69 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm6Q9CZ69 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm6Q9CZ69 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm6Q9CZ69 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm6Q9CZ69 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmtm6Q9CZ69 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmtm6Q9CZ69 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmtm6Q9CZ69 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmtm6Q9CZ69 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm6Q9CZ69 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm6Q9CZ69 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms