Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXS4

Cenpv, Centromere protein V, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpvQ9CXS4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CenpvQ9CXS4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CenpvQ9CXS4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CenpvQ9CXS4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CenpvQ9CXS4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CenpvQ9CXS4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CenpvQ9CXS4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CenpvQ9CXS4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CenpvQ9CXS4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CenpvQ9CXS4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CenpvQ9CXS4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CenpvQ9CXS4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CenpvQ9CXS4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CenpvQ9CXS4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CenpvQ9CXS4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CenpvQ9CXS4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms