Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pin4Q9CWW6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pin4Q9CWW6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms