Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atxn3Q9CVD2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atxn3Q9CVD2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn3Q9CVD2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms