Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MINDY3Q9CV28 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MINDY3Q9CV28 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms