Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otud1Q9CUB6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud1Q9CUB6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud1Q9CUB6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud1Q9CUB6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud1Q9CUB6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud1Q9CUB6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud1Q9CUB6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud1Q9CUB6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud1Q9CUB6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud1Q9CUB6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud1Q9CUB6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otud1Q9CUB6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otud1Q9CUB6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud1Q9CUB6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms