Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS74

Ecd, Protein ecdysoneless homolog, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EcdQ9CS74 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EcdQ9CS74 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EcdQ9CS74 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms