Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifitm3Q9CQW9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifitm3Q9CQW9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms