Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sec61bQ9CQS8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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