Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chchd5Q9CQP3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chchd5Q9CQP3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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