Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rdm1Q9CQK3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rdm1Q9CQK3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms