Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rpl39lQ9CQD0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rpl39lQ9CQD0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rpl39lQ9CQD0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rpl39lQ9CQD0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rpl39lQ9CQD0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rpl39lQ9CQD0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rpl39lQ9CQD0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Rpl39lQ9CQD0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl39lQ9CQD0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl39lQ9CQD0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl39lQ9CQD0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl39lQ9CQD0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl39lQ9CQD0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rpl39lQ9CQD0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rpl39lQ9CQD0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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