Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Mrpl49Q9CQ40 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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