Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Commd4Q9CQ02 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Commd4Q9CQ02 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms