Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bap1Q99PU7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bap1Q99PU7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms