Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DhddsQ99KU1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DhddsQ99KU1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms