Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp11Q99K46 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp11Q99K46 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms