Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ufsp2Q99K23 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufsp2Q99K23 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms