Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctu1Q99J10 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctu1Q99J10 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctu1Q99J10 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms