Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ppargc1bQ8VHJ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppargc1bQ8VHJ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms