Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Dnajc28Q8VCE1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Dnajc28Q8VCE1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Dnajc28Q8VCE1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Dnajc28Q8VCE1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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Dnajc28Q8VCE1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dnajc28Q8VCE1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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