Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV3

Exosc2, Exosome complex component RRP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc2Q8VBV3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exosc2Q8VBV3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc2Q8VBV3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms