Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Vmn1r200Q8R281 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Vmn1r200Q8R281 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Vmn1r200Q8R281 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Vmn1r200Q8R281 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Vmn1r200Q8R281 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Vmn1r200Q8R281 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Vmn1r200Q8R281 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Vmn1r200Q8R281 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Vmn1r200Q8R281 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Vmn1r200Q8R281 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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