Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim68Q8K243 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim68Q8K243 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms