Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hpf1Q8CFE2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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