Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snx8Q8CFD4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snx8Q8CFD4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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