Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrn3Q8CBC6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrn3Q8CBC6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms