Protein–RNA interactions for Protein: Q8CA72

Gan, Gigaxonin, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GanQ8CA72 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GanQ8CA72 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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GanQ8CA72 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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GanQ8CA72 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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GanQ8CA72 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GanQ8CA72 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GanQ8CA72 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GanQ8CA72 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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