Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dclre1bQ8C7W7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dclre1bQ8C7W7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dclre1bQ8C7W7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms