Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L0

Tmx4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx4Q8C0L0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmx4Q8C0L0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmx4Q8C0L0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmx4Q8C0L0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmx4Q8C0L0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmx4Q8C0L0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms