Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim47Q8C0E3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim47Q8C0E3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim47Q8C0E3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim47Q8C0E3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim47Q8C0E3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim47Q8C0E3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim47Q8C0E3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim47Q8C0E3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim47Q8C0E3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms