Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Strip1Q8C079 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Strip1Q8C079 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms