Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim35Q8C006 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim35Q8C006 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim35Q8C006 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim35Q8C006 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim35Q8C006 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim35Q8C006 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim35Q8C006 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim35Q8C006 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim35Q8C006 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim35Q8C006 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim35Q8C006 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim35Q8C006 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim35Q8C006 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim35Q8C006 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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