Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Skor1Q8BX46 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Skor1Q8BX46 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skor1Q8BX46 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms