Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rps6kb1Q8BSK8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps6kb1Q8BSK8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms