Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV1

Trmt2a, tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt2aQ8BNV1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt2aQ8BNV1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt2aQ8BNV1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt2aQ8BNV1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt2aQ8BNV1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trmt2aQ8BNV1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trmt2aQ8BNV1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt2aQ8BNV1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt2aQ8BNV1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trmt2aQ8BNV1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms