Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

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Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcaf1Q8BNE1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Tcaf1Q8BNE1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Tcaf1Q8BNE1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Tcaf1Q8BNE1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Tcaf1Q8BNE1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Tcaf1Q8BNE1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Tcaf1Q8BNE1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Tcaf1Q8BNE1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Tcaf1Q8BNE1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Tcaf1Q8BNE1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcaf1Q8BNE1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcaf1Q8BNE1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcaf1Q8BNE1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcaf1Q8BNE1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcaf1Q8BNE1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcaf1Q8BNE1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcaf1Q8BNE1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcaf1Q8BNE1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcaf1Q8BNE1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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