Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp54Q8BL06 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Usp54Q8BL06 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp54Q8BL06 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms